יש להיות בצום מלא במשך 4 שעות לפני הבדיקה.
אסור לעשן במשך לפחות 8 שעות לפני הבדיקה.
יש להפסיק ליטול טיפול אנטיביוטי ותרופות שמפחיתות חומצת קיבה או נגד צרבת לפחות 7 ימים לפני הבדיקה. לצורך כך, יש להיוועץ עם רופא. במידה ונוטלים טיפול נגד ההליקובקטר פילורי, יש לבצע את הבדיקה לפחות ארבעה שבועות לאחר התחלת הטיפול.
כדאי להצטייד במיץ תפוזים טבעי (לא מוגז), אך לא לשתות אותו לפני הבדיקה.